Światowej sławy inżynierowie i fizycy zostają wynajęci przez japoński rząd do prac nad nową bronią przeciwko radioaktywnemu mutantowi Godzilli. Korzystając z obcej technologii konstruują gigantycznego robota, Mechagodzillę, którego siła ognia i wysoka odporność na promienie cieplne jaszczura zapewni mu zwycięstwo w nadchodzącej bitwie. Tymczasem grupa paleontologów odkrywa na jednej z Wysp Kurylskich doskonale zachowane gigantyczne jajo dinozaura. Gdy bohaterowie usiłują zabrać je do Japonii, niespodziewanie obóz atakuje olbrzymi pteranodon Rodan a z morza wyłania się Godzilla...
