Musa, młody muezzin, zostaje wysłany do pełnienia swej funkcji w jednym z meczetów w stambulskiej Galacie. Pierwszy raz w życiu przyjeżdża do tego miasta. Wprowadza się do mieszkania, które zazwyczaj zajmowane jest przez muezzina tego meczetu. Tuż obok mieszka zakonnica Anna, wraz z opiekującą się nią Clarą. Spotkanie rozpoczynającego nowe życie w Stambule Musy z Clarą, której życie ogranicza się do kościoła i domu, wywołuje gorące i niezwykłe uczucie. Młodemu muezzinowi nawet przed samym sobą trudno jest się przyznać do tej miłości, tymczasem ogarnia go ona coraz mocniej.
Inna modlitwa to film przenoszący na ekran specyficzną atmosferę różnych religii Stambułu, ciekawe typy ludzkie oraz miejsca, których nie znajdzie się nigdzie indziej. Jest to film o miłości rozkwitającej w tym niezwykłym mieście i o smutku, który jej towarzyszy.
