Głównym bohaterem filmu jest Tad, robotnik z budowy w Chicago, który marzy by stać się archeologiem. Jego marzenie się spełnia, kiedy pomyłkowo zostaje wzięty za sławnego odkrywcę. Wraz z wiernym psem Jeffem, dzielną archeolożką Sarah, głupawą papugą Belzoni i dziwnym przewodnikiem Freddy'm bierze udział w ekspedycji do Peru w poszukiwaniu zagubionego miasta Inków. Tam wplątuje się w spisek uknuty przez łowców skarbów. Przygoda jest ekscytująca tym bardziej, że Tad panicznie boi się much i mumii. Komputerowa animacja jest pełnometrażową kontynuacją dwóch krótkometrażówek "Tadeo Jones" (2006) i "Tadeo Jones and the Basement of Doom" (2008), wyróżnionych hiszpańską narodową nagrodą filmową - Nagrodą Goya.
